Флеш - основное средство анимации, клиентских приложений, отказ от него значительно обедняет набор инстументов и возможности сайтов. Но чисто флеш имеет ряд серьезных проблем:
1) Остутствие ссылки на конкретную страницу
2) Проблемы с индексированием (поисковыми системами)
3) Не слушается браузера: Вперед, назад, крупнее шрифт, мельче...
4) Требует установки плагина, причем плагин далеко не всегда правильно работает. Например у меня дома девятый, но непоследний, новый не устанавливается, а тот, что есть глючит не по детски.
5) Главный минус - размер. Флеш всегда много весит и недоступен для диалапа.
Посему я делаю вывод, что нельзя использовать чисто флешевские сайты, а элементы флеша нужно использовать тогда, когда они действительно нужны. И всегда нужно делать сайт совместимым с выключенным флешем.